Riziko infekce BA.5 mezi lidmi vystavenými předchozím variantám SARS-CoV-2

Do redakce:

V posledních měsících se omicron (B.1.1.529) stal dominantní variantou těžkého akutního respiračního syndromu coronavirus 2 (SARS-CoV-2), který vykazuje určitý stupeň imunitního úniku.¹ Primární subvarianty omikronu, BA.1 a BA.2, jsou v mnoha zemích postupně vytlačovány BA.5, pravděpodobně kvůli zvýšené přenositelnosti a částečnému imunitnímu úniku způsobenému BA.1 a BA.2.^2,3 Ochrana poskytovaná BA.1 proti infekci podproměnnou BA.5 je kritická, protože adaptované vakcíny v klinických studiích jsou založeny na BA.1.

Portugalsko bylo jednou z prvních zemí postižených dominancí BA.5. Použili jsme Národní registr pro koronavirovou nemoc 2019 (Covid-19) (SINAVE) k výpočtu rizika infekce BA.5 mezi subjekty s dokumentovanou infekcí předchozími variantami, včetně BA.1 a BA.2. Registr zahrnuje všechny případy hlášené v zemi bez ohledu na klinický obraz.

Obrázek 1. Obrázek 1. Ochranný účinek předchozí infekce SARS-CoV-2 na infekci variantou Omicron BA.5.

Jak ukazuje panel (a), identifikovali jsme období (v různých barvách), ve kterých byla jedna varianta zastoupena ve více než 90 % izolátů vzorku (údaje z národního těžkého akutního respiračního syndromu koronavirus 2). [SARS-CoV-2] kontrola genetické diverzity⁴). Šedá období představují doby, kdy bylo v oběhu více než jedna proměnná. Vzhledem k relativně pomalému přechodu mezi dominancí omikronové varianty BA.1 a dominancí omikronové varianty BA.2 jsme v analýze sloučili BA.1 a BA.2. Nezahrnuli jsme žádné subjekty infikované během 90 dnů před dominancí subfaktoru omikron BA.5. Panel B ukazuje účinnost ochrany proti infekci během kontrolního období BA.5 (od 1. června 2022) mezi subjekty s jednou infekcí v období dominance různých variant, jak je uvedeno na panelu A, ve srovnání s subjekty bez zdokumentované infekce od 1. června. Lidé s infekcí před 1. červnem nebyli do studie zahrnuti. 𝙸 Sloupce představují 95% intervaly spolehlivosti.

Národní genetický dohled nad SARS-CoV-2 identifikoval období, kdy různé varianty tvoří více než 90 % izolátů.⁴ Identifikovali jsme všechny subjekty, které měly svou první infekci v kontrolních obdobích pro každou proměnnou, abychom vypočítali jejich riziko infekce během kontrolního období BA.5 (Obrázek 1a). BA.1 a BA.2 jsme sloučili kvůli pomalému přechodu mezi dvěma podproměnnými v populaci. Nakonec jsme vypočítali riziko BA.5 pro populaci, která neměla žádnou zdokumentovanou infekci před dominancí BA.5 (1. června 2022).

Zjistili jsme, že předchozí infekce SARS-CoV-2 měla ochranný účinek proti infekci BA.5 (Obrázek 1b a tabulka S1 v Doplňkové příloze, která je k dispozici s plným textem tohoto dopisu na NEJM.org), a tato ochrana byla maximální pro předchozí infekci BA.1 nebo BA.2. Tyto údaje je třeba vzít v úvahu v souvislosti s penetrační infekcí u vysoce očkované populace, vzhledem k tomu, že více než 98 % studované populace v Portugalsku dokončilo základní očkování před rokem 2022.

Návrh studie nemůže eliminovat všechny zmatky (viz sekce diskuse v Doplňkové příloze). Kromě toho je jedním omezením předpokládaný účinek snížené imunity v populaci s heterozygotní imunitou (předchozí infekce a očkování). Zjistili jsme, že infekce BA.1 nebo BA.2 u očkovaných subjektů poskytuje vyšší ochranu proti BA.5 než infekce preomikronovými variantami, což je v souladu s nedávnou zprávou o negativním designu testu.⁵ Infekce BA.1 nebo BA.2 se však vyskytly blíže období dominance BA.5 než infekce dřívějšími variantami. Existuje názor, že ochrana poskytovaná předchozí infekcí BA.1 nebo BA.2 je velmi nízká vzhledem k velkému počtu infekcí BA.5 u osob dříve infikovaných virem BA.1 nebo BA.2. Naše data naznačují, že toto vnímání je pravděpodobně výsledkem větší skupiny subjektů s infekcí BA.1 nebo BA.2 ve srovnání s infekcí jinými podproměnnými a není podporováno údaji.

Celkově jsme zjistili, že penetrující infekce s variantou BA.5 byly méně pravděpodobné u lidí s předchozí anamnézou SARS-CoV-2 ve vysoce očkované populaci, zejména u předchozích infekcí BA.1 nebo BA.2, než u neinfikovaných jedinců. .. .

Joao Malato, MA.
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Lisabon, Portugalsko

Roy M. Ribeiro, Phil D.
Národní laboratoř Los Alamos, Los Alamos, Nové Mexiko

Pedro P. Leite, MUDr
Pedro Casaca, MUDr
Eugenia Fernandezová, Ph.D.
Direção Geral da Saúde, Lisabon, Portugalsko

Carlos Antunes, Ph.D.
University of Lisboa, Lisabon, Portugalsko

MUDr.Válter R. Fonseca, Ph.D.
Direção Geral da Saúde, Lisabon, Portugalsko

Manuel C. Gomez, Ph.D.
University of Lisboa, Lisabon, Portugalsko

Luis Graca, MD, Phil D.
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Lisabon, Portugalsko
[email protected]

Tato zpráva byla zveřejněna 31. srpna 2022 na NEJM.org.